感染

新型冠状病毒SARS-CoV-2变种相对毒力的评估

作者:佚名 来源:MedSci梅斯 日期:2021-10-15
导读

         自2019年12月8日起,在中国武汉爆发了以呼吸道为主要症状的肺炎,经二代测序病毒分离和鉴定等手段,确定为一种新型的冠状病毒,世界卫生组织于2020年1月19日将其暂命名为2019新型冠状病毒(2019Novel Coronarius,2019nCoV),于2020年2月11日正式命名为SARS-Co-2病毒,引起的疾病称为2019冠状病毒病(COVD-19)。至2020年2月13日,中国新型

关键字:  新型冠状病毒 

        自2019年12月8日起,在中国武汉爆发了以呼吸道为主要症状的肺炎,经二代测序病毒分离和鉴定等手段,确定为一种新型的冠状病毒,世界卫生组织于2020年1月19日将其暂命名为2019新型冠状病毒(2019Novel Coronarius,2019nCoV),于2020年2月11日正式命名为SARS-Co-2病毒,引起的疾病称为2019冠状病毒病(COVD-19)。至2020年2月13日,中国新型冠状病毒肺炎确诊59895例,疑似病例16067例,死亡1367例;中国以外492例,波及日本、泰国等24个国家;随着诊断试剂的足量应用和疫情的进展,确诊病例数量可能更进一步增加,严重威胁到人们的生活和生命健康。因此,在2020年1月30日,世界卫生组织突发事件委员会经过讨论决定:将此次新型冠状病毒感染疫情确认为“国际关注的突发公共卫生事件”,以保护其他国家,尤其是为了保护一些医疗系统比较脆弱的国家,以便这些国家对此肺炎疫情进行更好的预防和控制。该病成为2009年HIN1、2014年脊髓灰质炎、2014年埃博拉、2016年寨卡、2019年埃博拉疫情之后,第6起国际关注的突发公共卫生事件。由此可见,此次新型冠状病毒疫情的严重性。

        背景:2021年2月至6月期间,新的SARS-CoV-2初始野生型毒株被变异毒株(VOCs)所取代在加拿大安大略省引起了关注,首先是具有N501Y突变(即Alpha/B1.1.17、Beta/B.1.351和Gamma/P)的毒株1变种),然后Delta/B.1.617变种。这些挥发性有机化合物的传播能力有所增加,但对其毒性的了解有限。

        目的:我们使用安大略省的COVID-19病例数据,以住院、重症监护病房(ICU)住院和死亡风险衡量,评估这些VOCs与非VOCs SARS-CoV-2菌株的毒性。

        方法:我们在安大略省对SARS-CoV-2检测呈阳性并筛查VOCs的人建立了回顾性队列,检测报告日期为2021年2月7日至6月27日。我们构建了以住院、ICU住院和死亡为结局变量的混合效应logistic回归模型。我们的模型调整了年龄、性别、时间、疫苗接种状态、并发症和妊娠状态。

        结果:我们的队列包括212 326人。与非VOCs SARS-CoV-2菌株相比,与N501Y阳性变异相关的校正风险升高,在住院方面为52%(95%可信区间[CI] 42%-63%),在ICU住院方面为89%(95%可信区间[CI] 67%-117%),在死亡方面为51%(95%可信区间[CI] 30%-78%)。Delta变异增加的风险在住院108% (95% CI 78%-140%)、ICU 235% (95% CI 160%-331%)和死亡133% (95% CI 54%-231%)时更明显。

        图 加拿大安大略省新型冠状病毒病例发生和住院分布、重症监护病房(ICU)入院和死亡趋势,按关注状态变量分类。按试验报告日期报告的新型冠状病毒感染病例,表示为研究期间报告病例的7天平均值。按检测报告周分列的新冠肺炎住院病例、重症监护室收治病例和挥发性有机化合物死亡病例的分布情况。案例根据指定的挥发性有机化合物状态进行着色。2021年5月1日前,仅通过全基因组测序检测出Delta病例。2021年5月1日之后,所有未被鉴定为N501Y阳性挥发性有机化合物(N501Y+挥发性有机化合物)或另一种变体的筛查标本都被归类为可能的德尔塔挥发性有机化合物感染。

        表 报告的新冠肺炎病例中住院、重症监护室入院和死亡的调整优势比*

        结论:SARS-CoV-2 VOCs毒力的增加将导致比无VOCs出现时更大、更致命的大流行。

        原文出处:

        FismanDN,TuiteAR,Evaluation of the relative virulence of novel SARS-CoV-2 variants: a retrospective cohort study in Ontario, Canada.CMAJ2021 Oct 04

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