感染

利用纳米孔全基因组测序追溯陆丰新冠病毒来源

作者:佚名 来源:MedSci梅斯 日期:2020-11-15
导读

         8月14日,广东省汕尾陆丰市报告发生一起新冠肺炎疫情,通过基因同源性比对确定不同病毒株间的亲缘关系和传播过程,能够为公共卫生防控措施提供有力证据和信息,对疫情防控意义重大。 广东省疾控中心微检所所长武婕牵头的团队第一时间采取5例感染个案的鼻咽拭子样本,使用纳米孔便携式一体化设备MinION Mk1C,结合ARTIC工作流程,及时完成了COVID-19病毒全基因组测序,与全球数据库中的近8万条新冠

关键字:  新冠病毒 

        8月14日,广东省汕尾陆丰市报告发生一起新冠肺炎疫情,通过基因同源性比对确定不同病毒株间的亲缘关系和传播过程,能够为公共卫生防控措施提供有力证据和信息,对疫情防控意义重大。

        广东省疾控中心微检所所长武婕牵头的团队第一时间采取5例感染个案的鼻咽拭子样本,使用纳米孔便携式一体化设备MinION Mk1C,结合ARTIC工作流程,及时完成了COVID-19病毒全基因组测序,与全球数据库中的近8万条新冠病毒全基因组序列进行比对分析,发现这5例同属于香港本地流行的HK1分支,与香港流行毒株的病毒序列高度同源,同源百分率达99.99%。

        8月22日,广东省人民政府举办的疫情防控新闻发布会通报了该研究结果,查看完整新闻发布会内容:http://www.gd.gov.cn/gdywdt/zwzt/yqfk/fbh/content/post_3070743.html。央视新闻官方微博、人民日报微信公众号对此进行了题为“【#广东陆丰疫情病毒溯源结果#:与香港流行毒株的病毒序列高度同源】”和““破案”了!与香港流行毒株高度同源”的报道。

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