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新型冠状病毒2019-nCoV/COVID-19最新研究进展

作者:佚名 来源:生物谷 日期:2020-04-28
导读

         自2019年12月8日以来,中国湖北省武汉市报告了几例病因不明的肺炎。大多数患者在当地的华南海鲜批发市场工作或附近居住。在这种肺炎的早期阶段,严重的急性呼吸道感染症状出现了,一些患者迅速发展为急性呼吸窘迫综合征(acute respiratory distress syndrome, ARDS)、急性呼吸衰竭和其他的严重并发症。2020年1月7日,中国疾病预防控制中心(China CDC)从患者

关键字:  新型冠状病毒 

        自2019年12月8日以来,中国湖北省武汉市报告了几例病因不明的肺炎。大多数患者在当地的华南海鲜批发市场工作或附近居住。在这种肺炎的早期阶段,严重的急性呼吸道感染症状出现了,一些患者迅速发展为急性呼吸窘迫综合征(acute respiratory distress syndrome, ARDS)、急性呼吸衰竭和其他的严重并发症。2020年1月7日,中国疾病预防控制中心(China CDC)从患者的咽拭子样本中鉴定出一种新型冠状病毒,最初被世界卫生组织(WHO)命名为2019-nCoV。大多数2019-nCoV肺炎患者的症状较轻,预后良好。到目前为止,一些患者已经出现严重的肺炎,肺水肿,ARDS或多器官功能衰竭和死亡。

        2020年2月11日,世卫组织将这种疾病病重命名为2019年冠状病毒病(COVID-19)。同一天,负责分类和命名病毒的的国际病毒分类学委员会的冠状病毒研究小组在bioRxiv上发表了一篇文章,指出该研究小组已经决定,新型冠状病毒2019-nCoV是导致2002-2003年爆发严重急性呼吸综合征(SARS)冠状病毒(SARS-CoV)的变种。因此,将这种新病原体重新命名为严重急性呼吸综合征冠状病毒2号(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2),或SARS-CoV-2。值得注意的一点是,尽管国际病毒分类委员会冠状病毒研究小组将病毒命名为SARS-CoV-2,但该研究小组主席John Ziebuhr认为这个名字(SARS-CoV-2)和SARS(严重急性呼吸综合征,也称非典型肺炎)没有关联。不过,这种病毒的重新命名引起了不少争议。据《科学》网站报道,世界卫生组织不满意SARS-CoV-2这个名字,而且不打算采用此名称。

        冠状病毒可引起多种动物的多系统感染。在此之前已有6种冠状病毒可以感染人类,它们主要引起人类的呼吸道感染:两种高度致命性的冠状病毒,即严重急性呼吸道综合征(SARS)冠状病毒(SARS-CoV)和中东呼吸综合征(MERS)冠状病毒(MERS-CoV);4种可导致温和的上呼吸道疾病的冠状病毒,即HCoV-OC43、HCoV-229E、HCoV-NL63和HCoV-HKU1。

        基于此次疫情给中国和全世界带来严重的危害,小编针对近期2019-nCoV/COVID-19研究取得的进展进行一番梳理,以飨读者。

        1.新发现!科学家鉴别出应对新型冠状病毒感染的免疫反应的潜在靶点!

        doi:10.1016/j.chom.2020.03.002

        近日,一项刊登在国际杂志Cell Host & Microbe上的研究报告中,来自美国La Jolla免疫研究所等机构的科学家们就通过研究首次分析了针对新型冠状病毒的机体有效免疫反应的潜在靶点,如今研究人员能利用已知的冠状病毒的数据来预测SARS-CoV-2的哪些部位能够激活宿主的免疫系统反应。

        研究者Alba Grifoni博士说道,SARS-CoV-2与SARS-CoV的亲缘关系最为密切;这项研究中,我们对基于来自研究所免疫表位数据库(IEDB)的可用数据进行分析,绘制了SARS-CoV已知的抗原表位并将相应的区域映射到了SARS-CoV-2上。IEDB含有来自3600种不同物种和病毒病原体资源库中的60万个已知的表位。

        图片来源:Grifoni et al./Cell Host & Microbe。

        研究者表示,他们能将10个B细胞表位映射到新型冠状病毒上,由于SARS-CoV-2与SARS-CoV具有高度的序列相似性,因此在SARS-CoV中具有免疫优势的相同区域也很有可能在SARS-CoV-2中也有优势。这些区域中有5个区域是在刺突糖蛋白中发现的,刺突糖蛋白能形成病毒的“冠状”结构,其中2个区域存在于膜蛋白中,膜蛋白能嵌入到包裹病毒基因组的保护性蛋白外壳的膜中,另外3个区域位于构成外壳的核蛋白中。

        在相同的分析中,研究者还发现,T细胞的表位也多与突触糖蛋白和核蛋白有关,在一种完全不同的方法中,研究人员利用表位预测算法来预测线性B细胞的表位,来自德克萨斯大学奥斯汀分校的研究人员最近研究确定了突触糖蛋白的三维结构,这就能能够帮助本文研究人员在预测表位时将蛋白质的空间结构考虑进去,同时这种方法也证实了他们之前所预测的两个可能的表位区域。

        为了证实基于SARS-CoV同源性所鉴定出的SARS-CoV-2 T细胞表位,研究人员比较了不同的抗原表位,利用相同的方法,研究者验证了根据与SARS-CoV序列相似性所确定的17个SARS-CoV-2 T细胞表位中的12个;最后研究者Sette说道,实际上我们发现,很多B细胞和T细胞表位在SARS-CoV-2和SARS-CoV之间具有高度保守性,这或许就为开发新型疫苗奠定了基础,靶向作用这些区域的疫苗策略或许能够帮助机体产生特殊的免疫力,不仅能提供交叉感染的保护能力,还能有效抵御病毒未来的进化。

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